@reddyGeneticFunctionalDrivers2017
Summary of novel genes
| Entity |
Tier 1 |
Tier 2 |
Tier 2 Pass |
Tier 2 Fail |
| DLBCL |
7 |
53 |
24 |
29 |
---
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New to this study, DLBCL Tier 1, 7
New to this study, DLBCL Tier 2, 53
DLBCL Tier 2, Pass QC, 24
DLBCL Tier 2, Fail QC, 29
Novel genes reported in this study
Tier 1
Tier 2
| Novel gene |
DLBCL tier |
Average variant quality |
QC outcome |
| ARID5B |
2 |
★ ★ ★ ★ ☆ |
Pass |
| BTBD3 |
2 |
★ ★ ★ ★ ☆ |
Pass |
| SETD5 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| ATR |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| BRINP3 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| CASP8 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| TGFBR2 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| TIPARP |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| CD22 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| NF1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| IKBKB |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| JUNB |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| KCMF1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MAGT1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MECOM |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| PTPN6 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MET |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| ZFX |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| YY1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| FOXP1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| FUBP1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| GOLGA5 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MSH6 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MCL1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| ANKRD17 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Fail |
| CDC73 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CHD1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CHD8 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CHST2 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DCAF6 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DDX10 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DICER1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| HRAS |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| LIN54 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MAP4K4 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MSH2 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| GNAS |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MYB |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| NCOR1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| NFKB2 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| PHF6 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| PIK3CD |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| PTPRK |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| ZFAT |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| ARID1B |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| RUNX1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CBLB |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| SYK |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| WAC |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| ZBTB7A |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| RARA |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DNMT3A |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MARK1 |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
See Also
The primary data supporting each of the mutations reported in this study can be viewed in IGV reports along with mutations unique to the GAMBL re-analysis.[@drevalRevisitingReddyDLBCL2023]
References