@reddyGeneticFunctionalDrivers2017

Summary of novel genes

Entity Tier 1 genes Tier 2 genes
DLBCL 7 53 
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This study, New Tier 1, 7
New Tier 1, DLBCL Tier 1, 7
This study, New Tier 2, 53
New Tier 2, DLBCL Tier 2, 53
All other DLBCL studies, DLBCL Tier 1, 121
All other DLBCL studies, DLBCL Tier 2, 145

Novel genes reported in this study

Tier 1

New gene DLBCL tier Rating of reviewed variants
ATM 1 ★ ★ ★ ☆ ☆
BIRC6 1 ★ ★ ★ ☆ ☆
HIST1H2BC 1 ★ ★ ★ ★ ☆
HNRNPU 1 ★ ★ ★ ☆ ☆
SETD1B 1 ★ ★ ☆ ☆ ☆
TOX 1 ★ ★ ★ ☆ ☆
UBE2A 1 ★ ★ ★ ☆ ☆

Tier 2

New gene DLBCL tier Rating of reviewed variants
ANKRD17 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
ARID1B 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
ARID5B 2 ★ ★ ★ ★ ☆
ATR 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
BRINP3 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
BTBD3 2 ★ ★ ★ ★ ☆
CASP8 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
CBLB 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
CD22 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
CDC73 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
CHD1 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
CHD8 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
CHST2 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
DCAF6 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
DDX10 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
DICER1 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
DNMT3A 2 ★ ☆ ☆ ☆ ☆
FOXP1 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
FUBP1 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
GNAS 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
GOLGA5 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
HRAS 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
IKBKB 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
JUNB 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
KCMF1 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
LIN54 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
MAGT1 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
MAP4K4 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
MARK1 2 ★ ☆ ☆ ☆ ☆
MCL1 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
MECOM 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
MET 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
MSH2 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
MSH6 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
MYB 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
NCOR1 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
NF1 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
NFKB2 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
PHF6 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
PIK3CD 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
PTPN6 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
PTPRK 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
RARA 2 ★ ☆ ☆ ☆ ☆
RUNX1 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
SETD5 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
SYK 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
TGFBR2 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
TIPARP 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
WAC 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
YY1 2 ★ ★ ★ ☆ ☆
ZBTB7A 2 ★ ☆ ☆ ☆ ☆
ZFAT 2 ★ ★ ☆ ☆ ☆
ZFX 2 ★ ★ ★ ☆ ☆

See Also

The primary data supporting each of the mutations reported in this study can be viewed in IGV reports along with mutations unique to the GAMBL re-analysis.[@drevalRevisitingReddyDLBCL2023]

References