@reddyGeneticFunctionalDrivers2017
Summary of novel genes
| Entity |
Tier 1 genes |
Tier 2 genes |
| DLBCL |
7 |
53 |
---
config:
sankey:
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width: 600
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prefix: '('
suffix: ' genes)'
---
sankey-beta
This study, New Tier 1, 7
New Tier 1, DLBCL Tier 1, 7
This study, New Tier 2, 53
New Tier 2, DLBCL Tier 2, 53
All other DLBCL studies, DLBCL Tier 1, 121
All other DLBCL studies, DLBCL Tier 2, 145
Novel genes reported in this study
Tier 1
Tier 2
| Novel gene |
DLBCL tier |
Average variant quality |
QC outcome |
| ANKRD17 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| SETD5 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| ARID5B |
2 |
★ ★ ★ ★ ☆ |
Pass |
| ATR |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| BRINP3 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| BTBD3 |
2 |
★ ★ ★ ★ ☆ |
Pass |
| CASP8 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| TGFBR2 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| TIPARP |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| CD22 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| NF1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| IKBKB |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| JUNB |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| KCMF1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MAGT1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| FOXP1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| FUBP1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| GOLGA5 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MSH6 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| CDC73 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CHD1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CHD8 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CHST2 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DCAF6 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DDX10 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DICER1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| DNMT3A |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| HRAS |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| LIN54 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MECOM |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MET |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| ZFX |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| YY1 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| MAP4K4 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MARK1 |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MCL1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MSH2 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| GNAS |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| MYB |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| NCOR1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| NFKB2 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| PHF6 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| PIK3CD |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| PTPN6 |
2 |
★ ★ ★ ☆ ☆ |
Pass |
| PTPRK |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| RARA |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| ARID1B |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| RUNX1 |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| CBLB |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| SYK |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| WAC |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| ZBTB7A |
2 |
★ ☆ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
| ZFAT |
2 |
★ ★ ☆ ☆ ☆ |
Fail |
See Also
The primary data supporting each of the mutations reported in this study can be viewed in IGV reports along with mutations unique to the GAMBL re-analysis.[@drevalRevisitingReddyDLBCL2023]
References